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  • 【GPU并行计算】利用OpenCL&OpenCLUtilty进行GPU并行计算


    问题背景介绍

    CPU:运算核心较少,在大规模并行计算能力上极受限制,擅长流程控制和逻辑处理

    GPU:运算核心较多,适合数据并行的计算密集型任务

    异构计算:CPU处理复杂的逻辑运算和流程控制,当需要处理大量类型统一的数据时,再调用GPU进行并行计算

    OpenCL和CUDA的区别&下载

    OpenCL(Open Computing Langugae,开放运算语言)是第一个面向异构系统(此系统中可由CPU,GPU或其它类型的处理器架构组成)的并行编程的跨平台的开放式标准。


    CUDA(Compute Unified Device Architecture,统一计算架构),是显卡厂商NVIDIA推出的运算平台。 该架构使GPU能够解决复杂的计算问题。 它包含了CUDA指令集架构(ISA)以及GPU内部的并行计算引擎。 开发人员可以使用C、 C++和FORTRAN(或者是OpenCL)来为CUDA架构编写程序,所编写出的程序可以在支持CUDA的处理器上以超高性能运行。


    CUDA和OpenCL,前者是配备完整工具包、针对单一供应商(NVIDIA)的成熟的开发平台,后者是一个开放的标准。OpenCL是一个API,在第一个级别,CUDA架构是更高一个级别,在这个架构上不管是OpenCL还是DX11这样的API,还是像C语言、Fortran、DX11计算,都可以支持。

    Choose & Download Intel® SDK for OpenCL™ Applications 

    CUDA Toolkit Archive | NVIDIA Developer 

    OpenCL的基本概念

    platform & device

        平台(platform)可被认为是不同厂商提供的OpenCL API的实现。如果一个平台选定之后一般只能运行该平台所支持的设备。就当前的情况来看,如果选择了Intel的OpenCL SDK就只能使用Intel的CPU来进行计算了,如果选择AMD的APP SDK则能进行AMD的CPU和AMD的GPU来进行计算。
        一般而言,A公司的平台选定之后不能与B公司的平台进行通信。

    平台由两部分组成,宿主机和设备:
    宿主机Host :宿主机一般为CPU,扮演组织者的角色。
    设备Device :通常称为计算设备,设备有一个或多个计算单元,计算单元又包含一个或多个处理单元。在设备上运行的程序被称为核函数 (对于核函数的编写,CUDA一般直接写在程序内,OpenCL是写在一个独立的文件中,并且文件后缀是.cl,由主机代码读入后执行)

    上下文context

     定义了整个OpenCL的运行环境,包括设备device、内核kernel、程序对象program、内存对象memory和命令队列CommandQueue :
    设备 device :        OpenCL程序调用的计算设备。
    内核 kernel :        在设备程序上执行运算的入口函数,在主机上调用。
    程序对象 program :        内核程序的源代码(.cl文件)和可执行文件。
    内存对象 memory :        计算设备执行OpenCL程序所需的变量。
    命令队列 CommandQueue :    队列控制着kernel如何执行以及何时执行等细节。

    内核kernel & 程序对象program 

    工作项(Work-item): 跟CUDA中的线程(Threads)是同一个概念,
    N多个工作项(线程)执行同样的核函数,每个Work-item都有一个唯一固定的ID号,一般通过这个ID号来区分需要处理的数据。work-item是抽象的计算单元,和物理层面分配的计算单元不完全对应,一个实际物理计算单元也可以分别计算多个work-item。
    工作组(Work-group):跟CUDA中的线程块(Block)是同一个概念,
    N多个工作项组成一个工作组,Work-group内的这些Work-item之间可以通信和协作。

    内核启动接口clEnqueueNDRangeKernel 

     

     

    基于GPU微体系结构的高性能并行计算研究
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    跟CUDA中的 “<<>>来指定kernel要调度的线程数量” 是同一个概念,定义了Work-group的组织形式。
    其中,三个重要参数:
    global_work_offset:     global_id的偏移量
    global_work_size:    总的work-item数量
    local_work_size:        虚拟的分区,定义work-group的中包含的work-item数量

    举个例子:获取当前坐标x

    get_global_id(0) = get_group_id(0) * get_local_size(0) + get_local_id(0) + get_global_offset(0) ;

    核函数 & 内核 & 内核启动

    一个简单的内核,将输入的二维数组中的数据乘以2后,放入输出数组中

     

     

    OpenCL的封装库: OpenCLUtilty

    GitHub - smistad/Tube-Segmentation-Framework: A software for fast segmentation and centerline extraction of tubular structures (e.g. blood vessels and airways) from different modalities and organs using GPUs and OpenCL 

    https://registry.khronos.org/OpenCL/specs/opencl-cplusplus-1.2.pdf

    https://github.com/smistad/OpenCLUtilityLibrary

    Pyopencl Tutorial .pdf
    pdf 0星 超过10%的资源 3.53MB
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    举例:A + B = C

    这里基于OpenCLUtilty开发opencl运行程序,A + B = C。流程类似上图。

     

    举例:3维数据的一阶特征计算

     一个开源的python包,用于从医学成像中提取放射组学特征

    Radiomic Features — pyradiomics v3.0.1.post15+g2791e23 documentation

     

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  • 原文地址:https://blog.csdn.net/jin739738709/article/details/126032835
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